高丹草SRAP-PCR反应体系优化及验证

doi:10.12190/j.issn.2096-1197.2022.01.13

北方农业学报 ›› 2022, Vol. 50 ›› Issue (1): 93-100.doi: 10.12190/j.issn.2096-1197.2022.01.13

高丹草SRAP-PCR反应体系优化及验证

石悦¹, 刘拴成¹, 房永雨², 丁海君², 吕二锁², 路玉红³

1.集宁师范学院生命科学与技术学院,内蒙古集宁 012000;
2.内蒙古自治区农牧业科学院草原研究所,内蒙古呼和浩特 010031;
3.敖汉旗四家子镇农业技术推广站,内蒙古四家子 024300

收稿日期:2022-01-11 出版日期:2022-02-20 发布日期:2022-04-11
通讯作者: 房永雨（1984—）,男,副研究员,博士,主要从事牧草育种与分子生物学的研究工作。
作者简介:石悦（1990—）,女,讲师,博士,主要从事饲用作物遗传育种的研究工作。
基金资助:
集宁师范学院博士科研启动基金项目（jsbsjj1901）; 内蒙古自治区自然科学基金项目（2018BS03011）

Optimization and verification of a simple sequence-related amplified polymorphism（SRAP）-PCR system in Sorghum-Sudan hybrid grass

SHI Yue¹, LIU Shuancheng¹, FANG Yongyu², DING Haijun², LYU Ersuo², LU Yuhong³

1. College of Life Science and Technology,Jining Normal University,Jining 012000,China;
2. Institute of Grassland,Inner Mongolia Academy of Agricultural and Animal Husbandry Sciences,Hohhot 010031,China;
3. Agricultural Technolongy Extension Station of Sijiazi Town in Aohan Banner,Sijiazi 024300,China

Received:2022-01-11 Online:2022-02-20 Published:2022-04-11

摘要/Abstract

摘要： 【目的】筛选高丹草SRAP-PCR反应的最佳体系。【方法】采用单因素和正交试验设计相结合的方法,对影响高丹草SRAP-PCR反应体系的5个因素（dNTP、DNA、引物、Taq DNA聚合酶、Mg²⁺）进行优化;并对高丹草SRAP-PCR优化体系进行验证。【结果】高丹草SRAP-PCR的最佳反应体系为：dNTP浓度275 μmol/L、模板DNA浓度3.0 ng/μL、引物浓度1.1 μmol/L、Taq DNA 聚合酶用量1.00 U、Mg²⁺ 浓度2.25 mmol/L,用ddH₂O补足至20 μL。【结论】筛选出的SRAP-PCR最佳体系扩增条带数目多、多态性丰富、重复性好。

关键词: 高丹草, SRAP-PCR, 正交试验设计, 体系优化, 验证

Abstract: 【Objective】To find the optimal Sorghum-Sudan hybrid grass SRAP-PCR reaction system.【Methods】The five components（dNTP,template DNA concentration,primers,Taq DNA polymerase,and Mg²⁺）were optimized using single-factor and orthogonal-design approaches. The optimized SRAP-PCR reaction system was verified.【Results】The best SRAP-PCR system for Sorghum-Sudan hybrid grass contained 275 μmol/L dNTP,3.0 ng/μL template DNA,1.1 μmol/L for each primer,1.00 U Taq DNA polymerase,and 2.25 mmol/L Mg²⁺,making up to 20 μL with ddH₂O. 【Conclusion】The optimized SRAP-PCR reaction system amplified many bands,with abundant polymorphism and good repeatability.

Key words: Sorghum-Sudan hybrid grass, SRAP-PCR, Orthogonal design, System optimization, Verification

中图分类号:

S544.9

石悦, 刘拴成, 房永雨, 丁海君, 吕二锁, 路玉红. 高丹草SRAP-PCR反应体系优化及验证[J]. 北方农业学报, 2022, 50(1): 93-100.

SHI Yue, LIU Shuancheng, FANG Yongyu, DING Haijun, LYU Ersuo, LU Yuhong. Optimization and verification of a simple sequence-related amplified polymorphism（SRAP）-PCR system in Sorghum-Sudan hybrid grass[J]. Journal of Northern Agriculture, 2022, 50(1): 93-100.

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高丹草SRAP-PCR反应体系优化及验证

Optimization and verification of a simple sequence-related amplified polymorphism（SRAP）-PCR system in Sorghum-Sudan hybrid grass

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