畜牧与饲料科学 ›› 2013, Vol. 34 ›› Issue (1): 18-18.doi: 10.12160/j.issn.1672-5190.2013.01.008
何建文[1] 党娟[1] 关平原[1,2] 李平安[1,2] 高魁[3]
HE Jian-wen, DANG Juan, GUAN Ping-yuan, LI Ping-an, GAO Kui ( 1.College of Veterinary Medicine, Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot 010018, China; 2.Key Laboratory of Clinical Diagnosis and Treatment Technology in Animal Disease, Ministry of Agriculture, Hohhot 010018, China;3.Bureau of Veterinary Medicine of Dongsheng Distract in Ordos City, Dongsheng 017000,China)
摘要: 参考GenBank中禽呼肠孤病毒176株(ARV176)S2基因设计引物.对禽呼肠孤病毒内蒙古地区分离株C-98和禽呼肠孤病毒天津地区分离株T-98进行总RNA的提取,以其为模板,应用RT—PCR方法扩增病毒S2基因的cDNA片段,将纯化的cDNA片段克隆到pEASY-T1栽体后进行序列测定。结果表明,获得的ARVC-98和ARVT-98的S2基因全长为1324bp,包括15bp的5’非编码区和58bp的3’非编码区,阅读框位于5’端第16位核苷酸和第1266位核苷酸之间。ARVC-98和ARVT-98分离株S2基因的核苷酸同源性很高.达到了99.8%。将C-98、T-98株的S2基因核苷酸序列和参考毒株的|s2基因序列进行同源性分析,结果表明,ARVC-98和ARVT-98分离株的Js2基因与参考毒株ARV176、ARV918、ARV919、ARV1733、ARVGX2010、ARVS1133和DRVYJLS2基因的核苷酸同源性最高,在99.2%-99.8%之间;与参考毒株ARV138和ARVAVS—BS2基因的核苷酸同源性在92.1%-94.1%之间:与参考毒株ARV601SI、ARV916和ARV1017—1Js2基因的核苷酸同源性在87.3%~87.8%之间;与参考毒株DRV091、DRVS12和DRVS14Js2基因的核苷酸同源性在77.3%-78.2%之间;与参考毒株MRV3、MRV3-iin-1和MRV3-T3D52基因的核苷酸同源性最低.在2.4%。5.5%之间。遗传进化树分析显示:ARVC-98和ARVT-98分离株与参考毒株共分为4个遗传进化分支。
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