畜牧与饲料科学 ›› 2016, Vol. 37 ›› Issue (12): 5-5.doi: 10.12160/j.issn.1672-5190.2016.12.002
包玉龙;张三润;徐宋瑶;周好乐
BAO Yu-long, ZHANG San-run, XU Song-yao, ZHOU Hao-le (Basic Medical College,Inner Mongolia Medical University,Hohhot 010110,China)
摘要: 旨在预测牡蛎肌联蛋白的基因exon-intron结构,并确定其一级结构及结构域。利用生物信息学方法,从牡蛎基因组数据中预测肌联蛋白基因的exon-intron结构,并进一步预测编码肌联蛋白的m RNA组成,从而确定该蛋白的一级结构,并检测其结构域;与同源蛋白进行序列比对,制作系统进化树以了解其在系统进化中的位置。结果表明,该蛋白基因在基因组中横跨200 kb的序列区域,预测编码肌联蛋白的mRNA大约由74 kb组成,推测相对分子质量约为2 700 ku;该蛋白由Ig、Fn、kinase结构域,PEVK结构域和unique序列组成;在系统发育方面,该蛋白归属于原口动物集团。牡蛎肌联蛋白是一种新型的肌联蛋白样蛋白。
中图分类号: