转录组测序及其在甜菜功能基因挖掘中的应用

doi:10.3969/j.issn.2096-1197.2018.05.06

北方农业学报 ›› 2018, Vol. 46 ›› Issue (5): 39-43.doi: 10.3969/j.issn.2096-1197.2018.05.06

转录组测序及其在甜菜功能基因挖掘中的应用

张自强;白晨;张惠忠;李晓东;付增娟;赵尚敏;鄂圆圆;张辉;王良;张必周

内蒙古农牧业科学院特色作物研究所,内蒙古呼和浩特010031

收稿日期:2018-07-20 出版日期:2018-08-19 发布日期:2019-08-19
作者简介:张自强（1984-），男，助理研究员，博士，主要从事甜菜分子育种的研究工作。
基金资助:
内蒙古自治区自然科学基金项目[2016Bs（LH）0305];农业部糖料产业技术体系项目（CARS-170104）

Transcriptome sequencing and its application in sugar beet functional gene resource discovery

ZHANG Ziqiang[1];BAI Chen[1];ZHANG Huizhong[1];LI Xixodong[1];FU Zengjuan[1];ZHAO Shangmin E Yuanyuan[1];ZHANG Hui[1];WANG Liang[1];ZHANG Bizhou[1]

Special Crop Institute,Inner Monlolia Academy of Agricultural and Animal HusbandPy Sciences,Hohhot 010031,China

Received:2018-07-20 Online:2018-08-19 Published:2019-08-19

摘要/Abstract

摘要： 由于转录组测序技术具有检测费用低、检测通量高、不受遗传背景影响等优势，使其成为当前挖掘基因的主要手段之一。文章首先个绍了转录组测序技术的基本情况，接着阐述了该技术在甜菜功能基因研究方面的进展，文章最后展望转录组测序技术在甜菜基因挖掘中的应用前景。通过转录组测序可以构建甜菜丰富的基因表达数据库，尤其是挖掘与甜菜产量、台糖量调控、抗逆性相关的基因资源，为后续基因克隆、分子标记辅助育种以及转基因育种等提供理论支持与基因资源。

关键词: 转录组测序;甜菜;功能基因挖掘

Abstract: Transcriptome sequencing technology had many advantages, such as low cost, high detection flux, and no influence on genetic background. In this paper, the status of the transcriptional sequencing technology was summarized, and then the research progress of its use in the functional genomics of beet was expounded. Finally, the prospect of its application in the sugar beet gene excavation was elaborated. The rich gene database of sugar beet can be constructed by the sequencing of transcriptional groups, especially for the gene resources related to beet yield and the regulation of sugar content and resistance. These constructs provide theoretical support and genetic resources for subsequent gene cloning, molecular marker-assisted breeding and transgenic breeding.

Key words: RNA-Seq;Sugarbeet;Functional gene excavation

中图分类号:

S566.3

张自强;白晨;张惠忠;李晓东;付增娟;赵尚敏;鄂圆圆;张辉;王良;张必周. 转录组测序及其在甜菜功能基因挖掘中的应用[J]. 北方农业学报, 2018, 46(5): 39-43.

ZHANG Ziqiang, BAI Chen, ZHANG Huizhong, LI Xixodong, FU Zengjuan, ZHAO Shangmin E Yuanyuan,ZHANG Hui,WANG Liang, ZHANG Bizhou （Special Crop Institute,Inner Monlolia Academy of Agricultural and Animal HusbandPy Sciences,Hohhot 010031, China）. Transcriptome sequencing and its application in sugar beet functional gene resource discovery[J]. Journal of Northern Agriculture, 2018, 46(5): 39-43.

[1]	韩平安, 唐宽刚, 常悦, 孙瑞芬, 王良, 张自强, 付增娟, 赵尚敏, 吴新荣, 李晓东. 基于CRISPR/Cas9技术创建甜菜BvCENH3基因突变体的研究[J]. 北方农业学报, 2023, 51(2): 1-11.
[2]	张辉, 王良, 付增娟, 李晓东, 赵尚敏, 鄂圆圆, 郑文哲, 张自强, 张必周, 张惠忠. VNTR分子标记在甜菜细胞质类型鉴定的应用研究[J]. 北方农业学报, 2022, 50(1): 1-10.
[3]	赵尚敏, 李晓东, 付增娟, 鄂圆圆, 张辉, 王良, 张自强, 郑文哲, 张必周, 白晨, 张惠忠. 基于SSR标记的甜菜种质资源遗传多样性及群体结构分析[J]. 北方农业学报, 2021, 49(1): 1-9.
[4]	罗静静, 王贺亚, 王康, 王付成, 王霞, 崔瑜, 白如霄, 杨哲. 新疆塔额垦区优质抗病甜菜新品种适应性评价[J]. 北方农业学报, 2021, 49(1): 17-22.
[5]	李智, 樊福义, 郭晓霞, 黄春燕, 任霄云, 宫前恒, 菅彩媛, 田露, 张强, 苏文斌. 减量施肥下甜菜产量及经济效益分析[J]. 北方农业学报, 2020, 48(4): 60-66.
[6]	杨洪泽, 张强, 董心久, 潘竟海, 沙红. 锌硼锰肥配合施用对甜菜产量、含糖率和产糖量的影响[J]. 北方农业学报, 2020, 48(4): 71-74.
[7]	张辉, 白晨, 张惠忠, 李晓东, 付增娟, 赵尚敏, 鄂圆圆, 郑文哲, 张自强, 王良, 张必周, 高慧. 越冬模式及前茬对二年生甜菜种子质量的影响[J]. 北方农业学报, 2020, 48(2): 16-20.
[8]	梁晓慧;史树德. 作物氮素快速营养诊断及其在甜菜上的应用前景[J]. 北方农业学报, 2019, 47(1): 49-56.
[9]	庞文强;张伟华;黄春燕;武毅昶;魏淑贞;李虹俞. 第3对真叶期甜菜幼苗对NaCl胁迫的抗逆性研究[J]. 北方农业学报, 2018, 46(2): 16-16.
[10]	贾敢敢白晨张惠忠李晓东张辉付增娟王良. 甜菜不育系育性核基因差异对应的2DE蛋白图谱差异分析[J]. 北方农业学报, 2016, 44(3): 1-1.
[11]	刘莹史树德. 不同施氮水平下甜菜光合特性比较[J]. 北方农业学报, 2016, 44(2): 7-7.
[12]	黄春燕苏文斌樊福义郭晓霞任霄云宫前恒. 甜菜实行糖料目标价格的可行性分析[J]. 北方农业学报, 2016, 44(1): 113-113.
[13]	孔令江尹成怀彭立刚张永奇. 赤峰市甜菜膜下滴灌综合配套栽培技术[J]. 北方农业学报, 2015, (1): 73-73.
[14]	代东明樊福义韩新田孟凡钢. 盐碱地栽植糖用甜菜与施肥[J]. 北方农业学报, 2014, (6): 29-29.
[15]	池慧芳翟丽丽刘丽娜韩永霞. 甜瓜组织培养研究进展及应用概况[J]. 北方农业学报, 2014, (5): 108-108.

转录组测序及其在甜菜功能基因挖掘中的应用

Transcriptome sequencing and its application in sugar beet functional gene resource discovery

PDF (PC)

赞

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

Metrics

本文评价

推荐阅读 0