新疆部分地区屠宰场羊源细粒棘球蚴分子鉴定及其遗传多样性分析

doi:10.12160/j.issn.1672-5190.2023.04.017

畜牧与饲料科学 ›› 2023, Vol. 44 ›› Issue (4): 122-128.doi: 10.12160/j.issn.1672-5190.2023.04.017

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新疆部分地区屠宰场羊源细粒棘球蚴分子鉴定及其遗传多样性分析

薛文^1,²,王凌云¹,王云峰¹,张振杰¹,赵爱云¹,王甜¹,齐萌¹

1.塔里木大学动物科学与技术学院/新疆生产建设兵团塔里木动物疫病诊断与防控工程实验室，新疆阿拉尔 843300
2.新疆维吾尔自治区动物疾病预防控制中心，新疆乌鲁木齐 830010

收稿日期:2023-07-04 出版日期:2023-07-30 发布日期:2023-08-30
通讯作者: 齐萌（1985—），男，教授，博士，硕士生导师，主要从事动物寄生虫学与寄生虫病学研究工作。王甜（1993—），女，讲师，硕士，主要从事包虫病病原生物学研究工作。
作者简介:薛文（1987—），女，硕士研究生，主要研究方向为动物群发病防治。
基金资助:
新疆生产建设兵团重点领域科技攻关计划项目(2020AB025);新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室开放课题项目(HS201907);塔里木大学校长基金项目(TDZKSS201905)

Molecular Identification and Genetic Diversity of Echinococcus granulosus Derived from Sheep in Abattoirs in Parts of Xinjiang Uygur Autonomous Region，China

XUE Wen^1,²,WANG Lingyun¹,WANG Yunfeng¹,ZHANG Zhenjie¹,ZHAO Aiyun¹,WANG Tian¹,QI Meng¹

1. College of Animal Science and Technology，Tarim University/Engineering Laboratory of Tarim Animal Disease Diagnosis and Control，Xinjiang Production and Construction Corps， Alar 843300，China
2. Animal Diseases Control and Prevention Center of Xinjiang Uygur Autonomous Region，Urumqi 830010，China

Received:2023-07-04 Online:2023-07-30 Published:2023-08-30

摘要/Abstract

摘要：

[目的]了解新疆维吾尔自治区部分规模化屠宰场羊的细粒棘球蚴感染情况及其分子遗传特征。[方法]收集屠宰场羊肝脏组织内经肉眼观察鉴定为细粒棘球蚴的包囊样本96份，全部提取基因组DNA后，基于细粒棘球绦虫cox1基因位点和nad1基因位点进行PCR扩增和测序。通过序列比对数据鉴定其基因型，构建遗传进化树解析其分子遗传特征。[结果]在cox1基因位点上，有81份样本呈PCR扩增阳性（84.37%，81/96），经序列分析鉴定，所有阳性样本均为细粒棘球蚴G1基因型（n=81），存在15个单倍型（Hap_1~15）；在nad1基因位点上，有67份样本呈PCR扩增阳性69.79%（67/96），经序列分析鉴定出2种基因型，分别为细粒棘球蚴G1基因型（n=66）和G3基因型（n=1），存在19个单倍型（Hap_1~19）。种系发育分析显示，获得的细粒棘球蚴G1基因型和G3基因型序列，与国内外已报道的多种宿主源的G1基因型和G3基因型序列均处于同一个进化支。[结论]新疆部分地区羊源细粒棘球蚴呈现遗传多样性分布特征，研究结果为该地区羊包虫病的防治提供了基础数据。

关键词: 细粒棘球蚴, 检测, 基因型, 单倍型, 羊

Abstract:

[Objective] The aim of this study was to understand the infection status and molecular genetic characteristics of Echinococcus granulosus （E. granulosus） derived from sheep in some large-scale abattoirs in Xinjiang Uygur Autonomous Region, China. [Method] A total of 96 cyst samples identified as E. granulosus by macroscopic observation were collected from the liver tissues of sheep in abattoirs. Following genomic DNA extraction, PCR amplification and sequencing were performed based on the cox1 and nad1 gene loci of E. granulosus. Sequence alignment was carried out to identify the genotype. The genetic evolution tree was constructed to analyze the molecular genetic characteristics. [Result] At the cox1 gene locus, a total of 81 samples were positive in PCR amplification （84.37%, 81/96）. Sequence analysis identified that all positive samples were G1 genotype of E. granulosus （n=81）, with 15 haplotypes （Hap_1-15） presented. At the nad1 gene locus, there were 67 PCR positive samples （69.79%, 67/96）. Two genotypes, G1 genotype （n=66） and G3 genotype （n=1） of E. granulosus, were identified through sequence analysis,with 19 haplotypes （Hap_1-19） presented. According to the phylogenetic analysis, the G1 and G3 genotypes of E. granulosus obtained in this study were in the same evolutionary branches as their counterparts of E. granulosus derived from the multiple host sources reported in China and abroad. [Conclusion] The E. granulosus derived from sheep in some parts of Xinjiang showed genetic diversity. Our results provide fundamental data for the prevention and control of echinocococosis in sheep in this region.

Key words: Echinococcus granulosus, detection, genotype, haplotype, sheep

中图分类号:

薛文, 王凌云, 王云峰, 张振杰, 赵爱云, 王甜, 齐萌. 新疆部分地区屠宰场羊源细粒棘球蚴分子鉴定及其遗传多样性分析[J]. 畜牧与饲料科学, 2023, 44(4): 122-128.

XUE Wen, WANG Lingyun, WANG Yunfeng, ZHANG Zhenjie, ZHAO Aiyun, WANG Tian, QI Meng. Molecular Identification and Genetic Diversity of Echinococcus granulosus Derived from Sheep in Abattoirs in Parts of Xinjiang Uygur Autonomous Region，China[J]. Animal Husbandry and Feed Science, 2023, 44(4): 122-128.

图/表 5

表1

图1

图2

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参考文献 20

[1]	BRUNETTI E, KERN P, VUITTON D A. Expert consensus forthe diagnosis and treatment of cystic and alveolar echinococcosis in humans[J]. Acta tropica, 2010, 114(1):1-16. doi: 10.1016/j.actatropica.2009.11.001
[2]	郭璐, 吴小霞, 段兰利, 等. 新疆部分地区牛、羊细粒棘球蚴感染情况调查及基因多态性分析[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2022, 40(5):603-609.
[3]	魏巍. 全国农牧系统包虫病防控[J]. 中国动物保健, 2017, 19(7):10-13.
[4]	吴星星, 蔡扩军, 王光雷, 等. 2010—2014年乌鲁木齐市羊屠宰场羊包虫病感染情况的调查[J]. 草食家畜, 2017(1):52-57.
[5]	尚婧晔, 张光葭, 何伟, 等. 细粒棘球蚴病病原分类学与分子流行病学研究进展[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2018, 36(2):166-173.
[6]	魏玉环, 胡媛, 曹建平. 细粒棘球绦虫基因多态性的研究进展[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2019, 37(4):481-485.
[7]	玛依拉·艾尼瓦, 马力克, 王冰洁, 等. 新疆伊犁地区包虫病流行病学调查及重点县家畜感染包虫的基因型[J]. 中国兽医学报, 2019, 39(12):2356-2363.
[8]	GUO B, ZHANG Z, GUO Y, et al. High endemicity of alveolar echinococcosis in Yili Prefecture, Xinjiang Uygur Autonomous Region, the People′s Republic of China: Infection status in different ethnic communities and in small mammals[J]. PLoS Neglected Tropical Diseases, 2021, 15(1):e0008891. doi: 10.1371/journal.pntd.0008891
[9]	OHIOLEI J A, YAN H B, LI L, et al. Cystic echinococcosis in Nigeria: first insight into the genotypes of Echinococcus granulosus in animals[J]. Parasites and Vectors, 2019, 12(1): 392. doi: 10.1186/s13071-019-3644-z
[10]	MOHAGHEGH M A, YOUSOFI-DARANI H, JAFARIAN A H, et al. Correction to: Isolated human and livestock Echinococcus granulosus genotypes using real-time PCR of cox1 gene in northeast Iran[J]. Acta Parasitologica, 2019, 64(3):686. doi: 10.2478/s11686-019-00133-w
[11]	GUO B, ZHANG Z, ZHENG X, et al. Prevalence and molecular characterization of Echinococcus granulosus sensu stricto in Northern Xinjiang, China[J]. Korean Journal of Parasitology, 2019, 57(2):153-159. doi: 10.3347/kjp.2019.57.2.153
[12]	陈晓英, 玉苏布江·赛提瓦尔, 史爱华, 等. 新疆克孜勒苏柯尔克孜自治州家犬棘球绦虫感染和家畜棘球蚴病流行病学调查[J]. 热带病与寄生虫学, 2016, 14(4):195-197.
[13]	GAO Y, WANG W, LYU C, et al. Meta-analysis of the prevalence of Echinococcus in sheep in China from 1983 to 2020[J]. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 2021, 11:711332. doi: 10.3389/fcimb.2021.711332
[14]	MEHMOOD N, DESSÌ G, AHMED F, et al. Genetic diversity and trans-mission patterns of Echinococcus granulosus sensu stricto among domestic ungulates of Sardinia, Italy[J]. Parasitology Research, 2021, 120(7):2533-2542. doi: 10.1007/s00436-021-07186-9
[15]	WU Y, LI L, ZHU G, et al. Mitochondrial genome data confirm that yaks can serve as the intermediate host of Echinococcus canadensis (G10) on the Tibetan Plateau[J]. Parasites Vectors, 2018, 11(1):166. doi: 10.1186/s13071-018-2684-0
[16]	KINKAR L, LAURIMÄE T, ACOSTA-JAMETT G, et al. Global phylogeography and genetic diversity of the zoonotic tapeworm Echinococcus granulosus sensu stricto genotype G1[J]. International Journal for Parasitology, 2018, 48(9/10):729-742. doi: 10.1016/j.ijpara.2018.03.006
[17]	热衣汗·玉素甫, 贾万忠, 闫鸿斌, 等. 新疆北疆部分地区牛羊包虫病流行病学调查与cox1和nad1基因分析[J]. 塔里木大学学报, 2020, 32(2):17-24.
[18]	薛新梅, 齐萌, 陶大勇, 等. 新疆和静县绵羊细粒棘球蚴流行株基因分型研究[J]. 中国奶牛, 2020(6):30-33.
[19]	VURAL G, BACA A U, GAUCI C G, et al. Variability in the Echinococcus granulosus Cytochrome C oxidase 1 mitochondrial gene sequence from livestock in Turkey and a re-appraisal of the G1-3 genotype cluster[J]. Veterinary Parasitology, 2008, 154(3/4):347-350. doi: 10.1016/j.vetpar.2008.03.020
[20]	KINKAR L, LAURIMAE T, ACOSTA-JAMETTT G, et al. Distinguishing Echinococcus granulosus sensu stricto genotypes G1 and G3 with confidence: A practical guide[J]. Infection Genetics and Evolution, 2018, 64:178-184. doi: 10.1016/j.meegid.2018.06.026

新疆部分地区屠宰场羊源细粒棘球蚴分子鉴定及其遗传多样性分析

Molecular Identification and Genetic Diversity of Echinococcus granulosus Derived from Sheep in Abattoirs in Parts of Xinjiang Uygur Autonomous Region，China

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[1]	邓朴明, 赵慧钢, 余复昌, 石团员, 孙洪超, 周炜, 周芷锦, 赵爱云, 齐萌. 杭州市规模化养殖场湖羊芽囊原虫的PCR检测与基因亚型鉴定[J]. 畜牧与饲料科学, 2024, 45(2): 103-108.
[2]	陈炯阳, 程艳, 伍志武, 王标, 杨燕燕, 杨青, 贺志雄, 谭支良. 澳洲白羊与呼伦贝尔羊杂交对母羊繁殖性能及妊娠期生殖激素分泌的影响[J]. 畜牧与饲料科学, 2024, 45(1): 42-47.
[3]	曾佳, 郭嘉庆, 夏方山, 李尹琳, 白朝瑞, 李韩晶. 不同株行距对白羊草种子产量及相关农艺性状的影响[J]. 畜牧与饲料科学, 2024, 45(1): 63-70.
[4]	徐聪, 李晶, 罗晓燕, 杨秋楠, 吴明伟, 宋诗雅, 朱禹坤, 杨曦, 吴志蕾, 李红霞. 云南省玉溪市羊肠道寄生虫感染情况调查及风险因素分析[J]. 畜牧与饲料科学, 2024, 45(1): 102-106.
[5]	马爱军, 李佳, 金敏, 金依璇, 刘诗语, 刘凯强, 刘燕, 甘露, 巴音查汗·盖力克. 新疆维吾尔自治区阿克苏地区牛羊体表蜱携带斑点热群立克次体调查[J]. 畜牧与饲料科学, 2024, 45(1): 107-113.
[6]	岱红艳, 白雪, 张宁, 张家新. 绵羊卵泡中抗氧化酶表达的研究[J]. 畜牧与饲料科学, 2023, 44(6): 66-75.
[7]	董贵, 于月通, 马志远, 王尧, 盛光玉, 陶大勇, 齐萌. 新疆维吾尔自治区和田地区规模化羊场腹泻羔羊源大肠杆菌的分离鉴定及毒力基因和耐药基因分析[J]. 畜牧与饲料科学, 2023, 44(6): 116-122.
[8]	白绥明, 辛雅明, 齐盟, 胡亮, 杨银凤. 枯草芽孢杆菌培养上清液对绵羊瘤胃上皮细胞β-防御素-1表达的影响[J]. 畜牧与饲料科学, 2023, 44(5): 8-14.
[9]	王静然, 李鹏飞, 刘苗, 陶艳琳, 刘亚男, 朱淑芬. 呼吸系统疾病与呼吸道微生态的研究进展[J]. 畜牧与饲料科学, 2023, 44(5): 30-38.
[10]	张博文, 司俊飞, 张振杰, 郭嘉栋, 陈荣, 赫永强, 余复昌, 齐萌. 新疆南疆某规模化绵羊养殖场腹泻羔羊隐孢子虫感染情况及其分子鉴定[J]. 畜牧与饲料科学, 2023, 44(5): 115-120.
[11]	斯钦孟和, 李胜利, 孙海洲, 张春华, 张乐, 张彦宁, 白雨. 加强“大数据+”科技服务，助推绒山羊产业高质量发展——以内蒙古鄂尔多斯市为例[J]. 畜牧与饲料科学, 2023, 44(4): 1-9.
[12]	张利妹,郭军,叶乐,刘雨佳,刘晓齐,郭灵芝. 内蒙古呼伦贝尔草原短尾羊内脏Se含量检测评价[J]. 畜牧与饲料科学, 2023, 44(4): 101-108.
[13]	刘凯强, 俞进, 段真真, 金敏, 李佳, 巴音查汗·盖力克. 新疆阿克苏地区蜱和羊感染无浆体的分子流行病学调查[J]. 畜牧与饲料科学, 2023, 44(3): 122-128.
[14]	王力伟, 刘永斌, 赵杰, 王标, 特日格勒, 何小龙, 付绍印, 姜丽丽, 唐雅茹, 何江峰. 饲粮添加酵母培养物对小尾寒羊屠宰性能及肌内氨基酸和功能成分的影响[J]. 畜牧与饲料科学, 2023, 44(3): 18-26.
[15]	毛飞, 程敏, 陈晓良, 段然, 孙洋, 李国俊, 王彩云. 哺乳动物精子获能信号通路及检测方法研究进展[J]. 畜牧与饲料科学, 2023, 44(3): 63-68.