布鲁菌疫苗株Rev.1全基因序列的测定与分析

doi:10.12160/j.issn.1672-5190.2020.05.017

畜牧与饲料科学 ›› 2020, Vol. 41 ›› Issue (5): 91-95.doi: 10.12160/j.issn.1672-5190.2020.05.017

布鲁菌疫苗株Rev.1全基因序列的测定与分析

于环宇¹, 张志丹¹, 刘建奇², 赵丹彤², 赵丽霞², 刘国英², 宋庆庆², 王国华³, 潘相臣³, 刘冬冬³, 田普厚³, 石顺利⁴, 关平原¹

1.内蒙古农业大学兽医学院, 内蒙古呼和浩特 010018;
2.金宇保灵生物药品有限公司兽用疫苗国家工程实验室, 内蒙古呼和浩特 010030;
3.内蒙古必威安泰生物科技有限公司, 内蒙古呼和浩特 011500;
4.内蒙古通辽市家畜繁育指导站, 内蒙古通辽 028000

收稿日期:2020-09-08 发布日期:2020-10-21
通讯作者: 关平原（1961—）, 男, 教授, 博士, 主要研究方向为动物传染病学。
作者简介:于环宇（1991—）, 女, 硕士, 主要研究方向为动物传染病学。

Genome-wide Sequencing and Analysis for Brucella Rev.1Vaccine Strain

YU Huan-yu¹, ZHANG Zhi-dan¹, LIU Jian-qi², ZHAO Dan-tong², ZHAO Li-xia², LIU Guo-ying², SONG Qing-qing², WANG Guo-hua³, PAN Xiang-chen³, LIU Dong-dong³, TIAN Pu-hou³, SHI Shun-li⁴, GUAN Ping-yuan¹

1.College of Veterinary Medicine, Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot 010018, China;
2.National Engineering Laboratory for Veterinary Vaccine, The Spirit Jinyu Biological Pharmaceutical Co., Ltd., Hohhot 010030, China;
3.Inner Mongolia Bigvet Biotech Co., Ltd., Hohhot 011500, China;
4.Livestock Breeding Guide Station of Tongliao City of Inner Mongolia, Tongliao 028000, China

Received:2020-09-08 Published:2020-10-21

摘要/Abstract

摘要： 为促进布鲁菌病Rev.1疫苗及相关疫苗的研发, 该研究提取Rev.1疫苗株核酸, 应用PacBio平台进行全基因序列测定与分析。结果表明, Rev.1疫苗株基因组大小约3 299 187 bp, G+C含量为57.2%, 组装为染色体1、染色体2两条环状基因组, 大小分别为2 121 370、1 177 817 bp, G+C含量分别为57.2%、57.3%。将其Ery、BLS和VirB10基因序列与9株GenBank上发表的布鲁菌参考菌株的Ery、BLS和VirB10基因序列进行比较分析, 存在不同程度的差异, 同源性为97.4%~100%。

关键词: 布鲁菌, 布鲁菌Rev.1疫苗株, 全基因组测序, 基因序列对比

Abstract: In order to promote the research and development of Brucella Rev.1 vaccine and related vaccines, the nucleic acid of the Brucella Rev.1 vaccine strain was extracted, and the genome-wide sequencing for Brucella Rev.1 vaccine strain was carried out and analyzed through PacBio platform. The results showed that the full-length genome of the Brucella Rev.1 vaccine strain was 3 299 187 bp, and the G+C content was 57.2%; two circular genomes of chromosome 1 and chromosome 2 were assembled; the size of chromosome 1 and chromosome 2 was 2 121 370 bp and 1 177 817 bp, respectively, and the G+C content of chromosome 1 and chromosome 2 was 57.2% and 57.3%, respectively. The sequences of Ery, BLS and VirB10 genes of the Brucella Rev.1 vaccine strain were bioinformatically compared and analyzed with their counterparts of 9 Brucella reference strains, and the sequence similarity among those genes were observed, ranging from 97.4% to 100%.

Key words: Brucella, Brucella Rev.1 vaccine strain, genome-wide sequencing, gene sequence comparison

中图分类号:

S852.614

于环宇, 张志丹, 刘建奇, 赵丹彤, 赵丽霞, 刘国英, 宋庆庆, 王国华, 潘相臣, 刘冬冬, 田普厚, 石顺利, 关平原. 布鲁菌疫苗株Rev.1全基因序列的测定与分析[J]. 畜牧与饲料科学, 2020, 41(5): 91-95.

YU Huan-yu, ZHANG Zhi-dan, LIU Jian-qi, ZHAO Dan-tong, ZHAO Li-xia, LIU Guo-ying, SONG Qing-qing, WANG Guo-hua, PAN Xiang-chen, LIU Dong-dong, TIAN Pu-hou, SHI Shun-li, GUAN Ping-yuan. Genome-wide Sequencing and Analysis for Brucella Rev.1Vaccine Strain[J]. Animal Husbandry and Feed Science, 2020, 41(5): 91-95.

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布鲁菌疫苗株Rev.1全基因序列的测定与分析

Genome-wide Sequencing and Analysis for Brucella Rev.1Vaccine Strain

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